云南省境內有長江、珠江、瀾滄江、伊洛瓦底江、怒江、紅河六大水系，其中瀾滄江、伊洛瓦底江、怒江、紅河均為國際河流，流經老撾、緬甸、泰國、越南等國家。

 

　　2019年，云南六大水系出境跨界斷面水質100%穩定達標，保持Ⅲ類以上水質。265個國控省控斷面水質優良率為84.5%，同比上升0.7個百分點。納入國家考核的100個地表水斷面水質優良比例為78%。

 

　　同時，云南以革命性舉措抓好九大高原湖泊保護治理，全力推進撫仙湖生態移民搬遷，實施洱海保護治理攻堅戰，打響滇池保護治理“三年攻堅”行動。

 

　　九大高原湖泊水質穩中向好，撫仙湖、瀘沽湖水質I類，陽宗海、洱海III類，滇池草海、程海IV類，滇池外海、杞麓湖、異龍湖V類，星云湖劣于V類。