南水進京后，在滿足生活使用的前提下，一部分南水將通過九級泵站反向輸水至密云水庫回補地下，讓北京的水源地得以“休養生息”。

　　12月24日，記者從北京市水務局了解到，南水進京后將從團城湖調節池一路北上，通過九級泵站一級一級反向輸水，通過京密引水渠將南水提升到密云水庫中。其中，部分南水將首先回補潮白河地下水源地。順義區水務局相關負責人介紹，在反向輸水過程中，途徑6級泵站時，會有部分南水經5.7公里的小中河道反向輸水至東牤牛河、懷河，最終入潮白河牛欄山橡膠壩上游水源地，在河道內通過下滲回補地下。

　　據介紹，順義區共有21條河道，205處的排污口，年污水排放量約9334.8萬方。為保障南水水源地的水質安全，順義區對全區排污口進行集中整治。目前，順義區水務局已經在蔡家河、方氏渠上建設了6座污水處理站，在小中河上建設3283米的截污管線，使85個排污口得到治理，其余的120個排污口將采取已建、在建、計劃新建污水處理廠，生活污水、養殖污水建設處理等多種辦法進行治理。